Naruto Uzumaki é um jovem rapaz, que é selado Kurama (Devetoopashatata Fox Demônio). Doze anos antes do início da história, fox atacado aldeia Konoha- escondido nas folhas, matando muitas pessoas. Para salvar Konoha da destruição certa, o líder da aldeia e ninjas nele - Quarta Hokage - sacrificou para selar o demônio em Naruto, no dia de seu nascimento. Moradores de Konoha, no entanto, tratou Naruto como se ele é um demônio e evitado durante a maior parte de sua infância. Terceiro Hokage, que substituiu a Quarta após a sua morte, aprovou uma lei que ninguém menciona o ataque na Fox em Konoha. Isto incluiu Naruto, que não estava ciente do demônio dentro dele. Anos mais tarde, Naruto é enganado por Mizuki traidor Naruto Costumes ninja para roubar um rolo de técnicas proibidas, mas foi parado por seu professor - Iruka Umino. Mizuki viola a proibição de revelar a verdade sobre selando o demônio então Naruto descobre que ele está fechado para Devetoopashatata Fox. Quando Iruka foi gravemente ferido defendendo Naruto de Mizuki, Naruto jutsu usou o que aprendeu com o livro e cria vários clones de si mesmo, a técnica Shadow Clone, para derrotar Mizuki.
A história principal segue Naruto e seus colegas da Academia de Ninjas. Naruto faz amizade com Sasuke e Sakura Haruno, que juntamente com ele na equipe 7 sob a supervisão do talentoso ninja Kakashi Hatake. Como todas as outras equipes na aldeia, Team 7 deve executar missões e solicita os camponeses, por exemplo, fazer trabalhos domésticos ou ter guarda-costas de alguém. Depois de várias missões, Kakashi permite que a equipe para participar do exame Chuunin que lhes permite adquirir uma classificação mais elevada e tomar parte em missões mais difíceis. Durante o exame, Orochimaru - o criminoso mais procurado de Konoha, atacou a aldeia e mata Terceiro Hokage de vingança. Um dos três ninjas lendários - Dzhirayya é encarregado de encontrar seus antigos colegas de equipa - Tsunade escolhido para se tornar o quinto Hokage. Durante a pesquisa, revelou que Orochimaru quer trazer Sasuke por causa de Naruto Costumes sua notável capacidade e herança genética. Acreditando que Orochimaru poderia lhe dar a força necessária para cumprir sua vingança contra seu irmão Itachi que matou todo o seu clã, Sasuke evitavam. Tsunade envia um grupo de ninja incluindo Naruto Sasuke retorno à Konoha, mas Naruto falhar em sua tentativa de derrotá-lo e trazê-lo de volta. Naruto não desistir e deixar Konoha para treinar para os próximos dois anos e meio com Dzhirayya como guardião, que se prepara para o seu próximo encontro com Sasuke.